A Enciclopédia Interdisciplinar de Ciência e Fé aborda alfabeticamente um conjunto de temas e figuras fulcrais na história do diálogo entre ciência e fé, abrangendo as Ciências Naturais e a Matemática, as Ciências da Vida e a Biologia, a Antropologia, o Humanismo e a Cultura, a História e a Filosofia, a Teologia, a Epistemologia e outras áreas do conhecimento, sendo complementada por diversos documentos da Igreja que enquadram as relações entre ambos os domínios.